Førstepersons skytespill Rainbow Six Siege spillet lar forskjellige operatører per esport-liga delta. Spillerne kontrollerer virtuelle operatører med forskjellige nasjonaliteter, gadgets og våpen. Med den asymmetriske strukturen kan det hende at team ikke får like evner. Counter-Terrorism Units kalles FBI SWAT i spillet og redder amerikanske gisler.
Forsvarere og angripere inkluderer også den tyske GSG-9, den britiske SAS, den franske GIGN og den russiske Spetsnaz. Hver enhet inneholder for operatører. Spillere kan rekruttere en operatør med muligheten til å velge utstyr og evner. Å velge nye operatører skjer i begynnelsen av en runde. Kjøp i spillet lar operatører kjøpe kreditt for kosmetiske gjenstander, skaffe operatører raskere eller våpen.
Etter begynnelsen av en runde velger angriperne spawn-poeng for å starte et angrep, og forsvarere bestemmer også forsvarsstrategi. I løpet av en kort forberedelsestidsramme kontrollerer angripere droner for kartspeiding for å søke etter opposisjonsoperatører, oppsett, mål og feller. Kart gir mulighet for nærkamp, og tillater kun gjenoppliving etter at runden er over.
Spillere hvis karakterer dør i løpet av spillet kan bruke en støttemodus for å få tilgang til drone- og sikkerhetskameraer og fortelle laget deres om fiendens aktiviteter og plasseringer. Uformelle kamper varer i fire minutter og rangerte kamper varer i tre minutter. Lagarbeid er avgjørende for R6-spillere for å beseire motstanderlaget. Ved å kommunisere med hver lagspiller kan et lagmedlem utnytte sine evner fullt ut og fullføre målet.
I tilskuermodus kan spilleren observere forskjellige vinkler på en kamp. Faktisk har spillet et tungt fokus på miljøets ødeleggelse. Spillere ødelegger strukturer med eksplosiver eller kuler. Etter å ha ødelagt et miljø, kan et lag få en fordel av fienden. Spillere som bruker kreativitet og strategi i spillet er bedre i stand til å navigere i systemet. Spillfunksjoner inkluderer et penetreringssystem, som skader fienden mindre når kuler passerer gjennom strukturer.
Forsvarende lag kan befeste murer og bruke skjold for beskyttelse. Imidlertid kan fienden bryte eller ødelegge disse beskyttelsene med eksplosiver og andre gadgets. Forsvarere bruker feller, inkludert piggtråd gjennom hele kartet. Spillere kan rappellere gjennom vinduer, ødelegge gulv og bakholde motstanderlaget. Granater og ladninger er verdifulle ødeleggelsesverktøy, som er begrenset i hver runde.